1941年,六合有识之士谢植梅先生创办了县立初级中学。后三易校址,五更校名。2003年,经省教育厅批准,学校更名为“江苏省六合高级中学”。2002年学校被江苏省教育厅确认为省国家级示范性普通高中,2004年转评为江苏省四星级普通高中,并于2009、2016、2023年顺利通过复审。
学校以荷花为文化标志,以荷的圣洁、高雅、执着的品质涵养师生求真向善的精神气质,引领风清气正的校风,形成荷香四溢的校园文化氛围。学校将“以人为本,促进师生整体持续发展”作为办学主张,以“培养会学习的现代文明人”为育人目标,不断深化教育教学改革,探索人文关怀与制度管理相融合的教育模式;设置多样化的校本课程,满足学生的个性需求和特长发展;构建有校本特色的多元评价体系,不断激励学生成功。近几年学校连续获得南京市普通高中发展性评估教学质量优秀奖、教学优秀管理奖、高考突出贡献奖等。
学校先后荣获江苏省文明单位、江苏省文明校园、江苏省教育工作先进集体、江苏省实施素质教育先进学校、江苏省德育先进学校、江苏省绿色学校、江苏省教育技术装备先进单位等多项荣誉称号。学校被南京大学、东南大学等近40所高校授予“优秀生源基地”称号。